Si trova nel rione Pigna (da cui il nome). Antichissima, era dedicata in origine ai santi martiri Eleuterio e Genesio. Una parte del corpo di quest'ultimo riposa infatti sotto l'altar maggiore, mentre un'altra parte fu concessa da Sisto V alla chiesa di S. Susanna. La chiesa ospitò numerose tombe dei Porcari, illustre famiglia della Roma medievale, e ne conserva numerose lapidi sepolcrali, alcune di notevole interesse Nel 1282 la chiesa era fatiscente e fu concessa alla Confraternita della Pietà verso i carcerati che la riedificò dalle fondamenta per i disegni dell'architetto Torroni. E allora fu dedicata a S. Giovanni Battista. All'altar maggiore un San Giovanni Battista di Baldassarre Croce.